Philippa Georgiou อดีตจักรพรรดิจาก Mirror Universe ที่เคยปกครองด้วยความโหดเหี้ยม ถูกดึงเข้าสู่หน่วยลับของสตาร์ฟลีตที่ชื่อว่า Section 31 องค์กรซ่อนเงาในเงามืดที่ทำหน้าที่ปกป้องสหพันธ์จักรวาลด้วยวิธีการที่ไม่เปิดเผยและมักจะอยู่นอกเหนือกฎเกณฑ์ปกติ
หลังจากถูกกดดันให้เข้าร่วม Georgiou ต้องทำงานร่วมกับทีมสายลับพิเศษที่ประกอบด้วยบุคคลจากหลากหลายเชื้อสายและความสามารถ โดยภารกิจหลักคือการตามหาและหยุดยั้งอาวุธทำลายล้างระดับจักรวาลที่ครั้งหนึ่งในอดีต Mirror Universe เธอเองคือผู้มีส่วนในการสร้างมันขึ้นมา อาวุธนี้หากตกอยู่ในมือของผู้ไม่หวังดีอาจเปลี่ยนสมดุลของจักรวาลไปตลอดกาล
ตลอดการเดินทาง Georgiou ต้องเผชิญหน้ากับบาปและความผิดพลาดในอดีตของตัวเอง ขณะเดียวกันก็ต้องพิสูจน์ให้เพื่อนร่วมทีมและสตาร์ฟลีตเห็นว่าเธอสามารถก้าวข้ามเงาของอดีตที่โหดร้ายได้ ภารกิจครั้งนี้ไม่เพียงเป็นการต่อสู้เพื่อหยุดยั้งภัยคุกคาม แต่ยังเป็นการต่อสู้ภายในใจของเธอเองว่าจะเป็นใครกันแน่ — จักรพรรดิผู้โหดเหี้ยม หรือสมาชิก Section 31 ที่พร้อมยอมเสียสละเพื่อปกป้องอนาคตของสหพันธ์จักรวาล
เรื่องราวดำเนินไปท่ามกลางการหักหลัง การสืบสวนลับ และการต่อสู้ที่เข้มข้น นำพา Georgiou และทีม Section 31 เข้าสู่การตัดสินใจครั้งสำคัญที่อาจนิยามชะตากรรมของพวกเขาและสหพันธ์ไปตลอดกาล.
